Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms