Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms