Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CC2D2AQ9P2K1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D2AQ9P2K1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D2AQ9P2K1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D2AQ9P2K1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D2AQ9P2K1 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D2AQ9P2K1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D2AQ9P2K1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D2AQ9P2K1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D2AQ9P2K1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D2AQ9P2K1 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D2AQ9P2K1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms