Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LRP1BQ9NZR2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms