Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS1Q9NYS0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS1Q9NYS0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS1Q9NYS0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS1Q9NYS0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS1Q9NYS0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms