Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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HOXC10Q9NYD6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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