Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms