Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms