Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XKR8Q9H6D3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms