Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMBRA1Q9C0C7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMBRA1Q9C0C7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMBRA1Q9C0C7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMBRA1Q9C0C7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMBRA1Q9C0C7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms