Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM4Q9C037 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms