Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01424-201ENST00000417820 1031 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357060.2-201ENST00000440578 1025 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00333-201ENST00000446314 613 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138089.1-201ENST00000450847 967 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP004833.1-201ENST00000507987 1238 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104113.1-201ENST00000607723 479 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2-AS1-201ENST00000630806 762 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms