Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms