Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms