Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GPR78Q96P69 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms