Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NSMCE2Q96MF7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms