Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOLD1Q96LR9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms