Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms