Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC11Q96DB2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms