Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDF1Q96CC6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms