Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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CLDN23Q96B33 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CLDN23Q96B33 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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