Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms