Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms