Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU6

PREX1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX1Q8TCU6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms