Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.1 ms