Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms