Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN22Q8N7P3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms