Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297.4 ms