Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms