Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIF1Q5UIP0 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms