Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms