Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD12Q587J7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms