Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms