Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP5B1Q2VPB7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP5B1Q2VPB7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms