Protein–RNA interactions for Protein: Q16643

DBN1, Drebrin, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBN1Q16643 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DBN1Q16643 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DBN1Q16643 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms