Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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