Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
USF2Q15853 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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USF2Q15853 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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USF2Q15853 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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USF2Q15853 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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USF2Q15853 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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USF2Q15853 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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USF2Q15853 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USF2Q15853 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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