Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SS18Q15532 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms