Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SYCP1Q15431 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SYCP1Q15431 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SYCP1Q15431 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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