Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CBFBQ13951 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CBFBQ13951 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBFBQ13951 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBFBQ13951 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBFBQ13951 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBFBQ13951 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBFBQ13951 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBFBQ13951 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBFBQ13951 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBFBQ13951 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CBFBQ13951 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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