Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms