Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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