Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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