Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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