Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TUBB3Q13509 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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