Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms