Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NFX1Q12986 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms