Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CNTN1Q12860 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CNTN1Q12860 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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