Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms