Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms